Bombový útok v Kremli vrhne na agentúru IMF podozrenie z medzinárodného terorizmu. Agent Ethan Hunt sa preto so svojím elitným tímom sťahuje do ilegality. Kým sa skupina snaží očistiť meno agentúry, vyjde najavo sprisahanie s cieľom rozpútať jadrovú vojnu. Pre záchranu sveta musia agenti využiť všetky kúzla moderných technológií, ktoré majú v zásobe. Táto misia je riskantnejšia než všetky predošlé - je jednoducho nesplniteľná. Špionážna agentúra IMF má obrovský problém. Vo chvíli, keď agent Ethan Hunt vykonával tajnú operáciu v Moskve, niekto spáchal bombový útok na Kremeľ. Ruskí predstavitelia dokonca hovoria o vojnovom akte. Keďže sa všetky nitky zbiehajú práve v IMF, americký prezident dá pre istotu od agentúry oficiálne ruky preč a vyhlási Ghost Protocol, čím ju odreže od zdrojov, zázemia, podpory a z jej členov urobí ľudí na odstrel. Krátko po tomto byrokratickom údere zomiera násilnou smrťou jej oficiálny šéf. Ethan Hunt sa preto pokúsi o nemožné. Spoločne s trojicou verných a odhodlaných kolegov Benjim, Jane a Brandtom sa pokúsi nájsť páchateľa útoku a očistiť svoje meno. Zároveň však odhalí sprisahanie s cieľom rozpútať jadrovú vojnu, ktorou chce šialený švédsky vedec Hendricks pomôcť evolúcii a urýchliť obmenu sveta. Cynický protivník ide neústupne za svojím cieľom a vždy je o krok pred svojím prenasledovateľom. Supergant Hunt sa musí najskôr dostať z moskovského väzenia, potom s agentmi Benjim Dunnom a krásnou Jane Carterovou prenikne do Kremľa, a s agentom Willom Brandtom prenasleduje nepriateľa do Dubaja a indickej megalopolis Bombaja. V boji za záchranu sveta v súčasnej podobe musia agenti využiť všetky kúzla moderných technológií, ktoré majú v zásobe. Táto misia je preto oveľa riskantnejšia než všetky predošlé - je jednoducho nesplniteľná.