Ve druhé kapitole trilogie Matrix je město Zion obléháno armádou strojů s umělou inteligencí. Jen několik hodin předtím, než 250 000 smrtících kovových chobotnic zničí poslední lidskou enklávu na Zemi, se Neo (Keanu Reeves) a Trinity (Carrie-Anne Moss) rozhodnou vrátit do Matrixu s Morfeem (Laurence Fishburne) a použít svůj arzenál mimořádných schopností a zbraní, aby vzdorovali útlaku a vykořisťování. Ve spleti lásky a pravdy, víry a poznání, cílevědomosti a obětavosti musí Neo následovat cestu, která je mu předurčena, aby zachránil lidstvo před temným osudem ze svých nočních můr.