Lucia je tehotná a nevie, či to má povedať Tomášovi. V tomto stave bude pre ňu ťažké liečiť pacientku, matku samoživiteľku, ktorú zmlátil jej bývalý klient. Tomáš nemá čas riešiť s Luciou jej tehotenstvo, pretože ho zamestnávajú hoteloví hostia s otravou botulotoxínom a Saša, ktorá chce za každú cenu urobiť z hromadnej otravy aféru. Jej matka - starostka príde na urgent s krajským hygienikom a chce riadiť boj proti neexistujúcej epidémii, ktorá nikde nevypukla a ani sa nikam nešíri. Ste na urgentnom príjme, začína sa boj o život. Seriál z prostredia urgentného príjmu v nemocnici Rubava sleduje prípady inšpirované skutočnými osudmi pacientov, lekárov a zdravotníkov. Modrý kód sa vyhlasuje pri neštandardných situáciách, od náhleho ohrozenia pacienta na živote až po mimoriadnu udalosť, napríklad hromadné nešťastie, kedy musí byť v pohotovosti celé oddelenie a všetky zložky záchranného zboru. Seriál Modrý kód nás prenesie na urgentný príjem nemocnice, kde sa boj o život pacientov začína. Verne zobrazuje realitu lekárskeho prostredia, pretože na jeho príprave spolupracoval široký tím odborných poradcov z radov záchranárov a lekárov.