Vrchná sestra Mery na prechádzke s doktorom Nývltom zachraňujú malého chlapca, na ktorého zaútočil rozzúrený pes. Čo je však horšie, psa, ktorý pohrýzol dieťa aj lekára, nelegálne priviezli z dovolenky v krajine, kde sa neočkuje proti besnote. Je veľmi pravdepodobné, že obaja sú nakazení. Starostka žiada doktora Davida Hofbauera, aby dal šancu jej dcére Saši s atestačnou prácou. David jej šancu už dal a chce, aby ju prepísala. Lenže Saša radšej urobí čokoľvek iné, len aby atestačnú prácu prepisovať nemusela. Ste na urgentnom príjme, začína sa boj o život. Seriál z prostredia urgentného príjmu v nemocnici Rubava sleduje prípady inšpirované skutočnými osudmi pacientov, lekárov a zdravotníkov. Modrý kód sa vyhlasuje pri neštandardných situáciách, od náhleho ohrozenia pacienta na živote až po mimoriadnu udalosť, napríklad hromadné nešťastie, kedy musí byť v pohotovosti celé oddelenie a všetky zložky záchranného zboru. Seriál Modrý kód nás prenesie na urgentný príjem nemocnice, kde sa boj o život pacientov začína. Verne zobrazuje realitu lekárskeho prostredia, pretože na jeho príprave spolupracoval široký tím odborných poradcov z radov záchranárov a lekárov.