Špeciálni agenti Mulder a Scullyová pátrajú po svojom šéfovi Skinnerovi. Nakoniec ho nájdu v malom mestečku, kde ho miestne úrady obvinili z vraždy. Agenti musia očistiť Skinnerovo meno a pomôcť mu s hľadaním pravdy. Počas vietnamskej vojny bol členom jednotky, ktorá sa mala stretnúť s neznámymi monštrami. Prípad nebol doriešený a v súčasnosti sa monštrá objavili znova. Akty X sú znova otvorené! Pravda je však stále vo hviezdach. Špeciálni agenti FBI Mulder a Scullyová pokračujú vo vyšetrovaní mysterióznych prípadov súvisiacich s pôsobením mimozemskej civilizácie na Zemi a nevysvetliteľnými paranormálnymi javmi. Zároveň obaja hľadajú svojho nezvestného syna Williama. Bude to cesta extrémne nebezpečná. Pátrajú po ňom totiž aj sprisahanci plánujúci mimozemskú kolonizáciu Zeme a vyhladenie ľudstva mimozemským patogénom. William svojou existenciu totiž extrémne ohrozuje ich plány, a tak ho musia zničiť za každú cenu. Po tom, čo sa dozvedia meno rodiny, ktorá si adoptovala ich syna, Mulder a Scullyová sa vydávajú na cestu plnú prekážok, ktoré nie vždy pochádzajú z tohto sveta.