Kapitán Phillips nastupuje na zaoceánskou nákladní loď Maersk Alabama, která má namířeno do Mombasy v Keni. Je si vědom nebezpečí hrozícího od somálských pirátů, a tak na lodi s prvním důstojníkem zavádí přísná bezpečnostní opatření. Při jednom cvičení posádky je Alabama pronásledována piráty. Protože piráti odposlouchávají jejich radiovou komunikaci, předstírá kapitán, že komunikuje s válečnou lodí určenou na jejich ochranu. Jeden ze dvou člunů, které Alabamu pronásledují, se otáčí, druhý však vytrvává. Jeho velitel Muse na lest neskočí. Brázda, kterou za sebou Alabama vytváří, nedovoluje pirátům přiblížení. Druhý den Muse vybaví svůj člun dvěma motory a vydává se Alabamu napadnout. I přes omezené prostředky na obranu se posádka statečně brání, ale nakonec se pirátům podaří dostat na palubu. Richard nařizuje posádce, aby se schovala ve strojovně, a sám s prvním důstojníkem a kormidelníkem se nechává zajmout kapitánem somálských pirátů Musem.